Företagsregistret får uppgifter från administrativa källor, av vilka Skatteförvaltningen är den viktigaste källan. I framställningen av uppgifter utnyttjas också Patent- och registerstyrelsens officiella bokslutsuppgifter.
Statistikcentralen samlar in en del av uppgifterna direkt från företag och sammanslutningar med hjälp av enkäter, med vilka man utreder bl.a. näringsgren, antalet anställda samt uppgifter om arbetsställestrukturen. Enkäter sänds årligen till merparten av företagen med flera arbetsställen samt som rotation till företag med ett arbetsställe med över 20 anställda. Samma enheter är inte med varje år. Nya företag, omkring de 2 500 största, får enkäten i januari året efter att de startat sin verksamhet.
Därtill använder Statistikcentralen flera andra källor t.ex. för att utreda ändringar i näringsgrenen, belägenhetsadresser och telefonnummer.